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                miRWalk:microRNA综合数据库
                栏目:最新研究动态 发布时间:2021-10-18
                miRWalk数据库是一个集miRNA查询、miRNA靶基因及pathway查询于一体◥的在线、免费数据库。包括人、大鼠、小鼠、狗、牛和鱼6物种......


                miRWalk数据库是一个集miRNA查询、miRNA靶基因及pathway查询于一体的在线、免费数据库。包括人、大鼠、小鼠、狗、牛和鱼6物种。

                                                               


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                miRNA查询


                       首先选择要查询物种,然后输入miRNA名称(注意名称中使用“-”而非下划线),可以获取miRNA序列及靶基因列表。miRWalk中靶∏基因列表可以点击“Export”输出为csv格式文件。


                如果按基因查询,可以输入基因↙名、基因ID等。查询结果将显示基因基本信息及靶向该基因的miRNA列表。


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                Target Mining



                该模块可以对多个 miRNA /基因/特定通路进行搜索。


                       根据miRNA列表搜索,需要选择物种、ID类型。结果页面为靶基因列表,“Graph”为网络图结果,GSEA可以在KEGG、GO层面对靶基因进行富集分析。(根据基因搜索步骤、结果页内容与miRNA相同)


                      根据Pathway搜索,选择物种、数据库之后,下拉列表选择特定的通路即可查询。结果页面为靶向该通路中所有基因的miRNA。