环状RNA(circRNA)和长链非编♀码RNA(lncRNA)是一类○非编码RNA,不翻译蛋白。但在细〖胞中它们能够调控其他基因的表达变化。近¤年的研究表明circRNA和lncRNA分子富含microRNA结合位点,在细胞中◣起到miRNA海绵(miRNA sponge)的作用,进而解除miRNA对其靶基因的抑制☆作用,升高靶基因的表①达水平,这一作用机制被称为竞争性内源RNA(ceRNA)机制。因此,通过与№疾病关联的miRNA相互作用,circRNA和lncRNA在疾病中发挥着重要的调控作用。研究cirRNA、lncRNA的调控机制需要先找到与※cirRNA、lncRNA相互作用的↑miRNA,而荧光素酶报告基因实验可以用来证明miRNA与circRNA, miRNA与lncRNA的直接相互『作用。
英拜生物microRNA报告基因实验流程:
1. microRNA靶点的◤预测
利用Targetscan,miRanda,PicTar软件得到目的microRNA的预□测靶点序列。
2. 获得microRNA靶点序列
根据提供的靶序①列,合成两条互补的单链DNA模板。或者,设计引物PCR扩增microRNA靶基因序◣列(lncRNA,circRNA全长序列或靶标序列)。
3. cirRNA靶序列克隆
将合成的两条单链退火成双链(具有粘性末端),或将PCR产⌒ 物双酶切,后连入经过同样双酶切的Psicheck-2载体中,连接产物转化大肠杆菌DH5α。
4. 阳▽性克隆鉴定。
挑选转化的〗菌落,PCR筛选含有插入片段的阳性克隆,测序验证克隆的序列△和目的microRNA靶序列一致。
5. 细胞转▂染准备
将psicheck-2报告基因载体、microRNA mimics或microRNA negative control共转染293T或Hela细胞。
6. 荧∩光素酶检测
报告基因载体与microRNA mimics或microRNA negative control共转染293T或Hela细胞24-72h后,进行双荧光素█酶检测,确定目的microRNA的靶基因。
7. 整理分析数据,得出结论。
提供有microRNA靶序列的报告基因质粒、甘油保存菌︻株各一支。附实∮验报告,包括载体构建过程,鉴定记录,测序报告,细胞转染,荧光检测。